Die DNA-Bank Berlin-Dahlem

Die DNA-Bank Berlin-Dahlem


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Die DNA-Bank des Botanischen Gartens und Botanischen Museums Berlin-Dahlem (BGBM) ist Teil des DNA-Bank-Netzwerkes. Dieses Projekt wurde im Frühjahr 2007 begonnen und wird von der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG) gefördert.
In der DNA-Bank werden DNA-Proben vorgehalten, die aus Pflanzen gut dokumentierter Naturstandorte extrahiert wurden. Das Ziel dieser DNA-Bank ist es, die taxonomische und evolutionsbiologische Forschung zu unterstützen, durch

die Bereitstellung von DNA zum Selbstkostenpreis, um pflanzliches Untersuchungsmaterial allgemein verfügbar zu machen (unter Berücksichtigung der Internationalen Biodiversitätskonvention).
eine langfristige Lagerung von DNA-Material, das für molekularbiologische Untersuchungen verwendet wurde, um Ergebnisse ergänzen, verbessern oder revidieren zu können.
die Bereitstellung der vollständigen Dokumentationen zu jeder Probe. Diese umfasst die Herkunft des Pflanzenmaterials, den Herbarbeleg (mit digitalen Bildern online abrufbar), die verwendete DNA-Extraktionsmethode und eine Verknüpfung zu bestehenden molekularbiologischen Daten (wenn veröffentlicht).

Die DNA der Sammlung stammt entweder aus molekularen Forschungsprojekten, die am BGBM durchgeführt wurden, oder aus Spenden von Wissenschaftlern anderer Institutionen, die unter den unten näher beschriebenen Qualitätsanforderungen akzeptiert wurde. Die Herkunft jeder DNA-Probe ist dokumentiert und eine Verknüpfung mit dem entsprechenden digitalisierten Herbarbeleg ist online abrufbar. Die DNA-Extraktionsmethode, das entsprechende Datum sowie das Zugangsjahr in die DNA-Bank sind für jede Probe angegeben. Die DNA-Konzentration der Proben variiert, je nach Ausgangsmaterial und spezifizierter Extraktionsmethode. Die Proben werden bei - 20°C gelagert und sind soweit gereinigt, dass sie bei Raumtemperatur während des Transportes nicht degenerieren.

[verfügbare DNA-Proben]

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Das Ausgangsmaterial der DNA sind lebende oder kultivierte Pflanzen mit dokumentierter Herkunft des Naturstandortes, Silica-Gel getrocknete Proben (die mit Genehmigung der entsprechenden Herkunftsländer in der Natur gesammelt wurden), oder geeignete Herbarexemplare. Nur DNA-Proben mit entsprechenden Herbarbelegen (hinterlegt, entweder am BGBM oder in anderen öffentlich zugängigen Herbarien) werden in der DNA-Bank gelagert. Zugehörige Datenbank-Informationen beinhalten den wissenschaftlichen Namen, unter dem Sequenzen dieses Taxas veröffentlicht sind, Sammler, Sammelort und -datum, digitale Bilder der Herbarbelege oder für kultivierte Pflanzen die Herkunft des Naturstandortes.
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DNA-Spenden werden zum Nutzen der Wissenschaft und der Verifizierbarkeit von Ergebnissen unentgeltlich in die DNA-Bank integriert, wenn folgende Bedingungen erfüllt sind: (1) alle notwendigen Dokumentationsangaben müssen bereitgestellt werden (Sammeldaten, Bestimmung, Methode und Datum der Entnahme); (2) ein vollständig beschrifteter Herbarbeleg muss entweder beim BGBM hinterlegt werden oder, wenn er in einem anderen Herbarium verbleibt, als Leihgabe zum Zweck der Digitalisierung an das BGBM verliehen werden und (3) es muss bescheinigt werden, dass das Pflanzenmaterial unter Berücksichtigung der Internationalen Biodiversitätskonvention gesammelt wurde. Der Spender der DNA wird in der Datenbank genannt, überträgt aber alle Rechte an den BGBM.
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DNA Proben werden auf Nachfrage zum Selbstkostenpreis (Entnahme, Lagerung, Dokumentation, Bearbeitung, Versand) für wissenschaftliche und pädagogische Zwecke zur Verfügung gestellt. Die Ergebnisse aus der Analyse des Material dürfen nicht zur Erzielung kommerzieller Gewinne benutzt werden, ohne vorherige schriftliche Erlaubnis vom Botanischen Garten und Botanischen Museum Berlin-Dahlem. Diese Erlaubnis wird nicht erteilt, wenn nicht gleichberechtigte Gewinnbeteilung mit den Herkunftsländern im Wortlaut und Sinne der internationalen Biodiversitätskonvention gesichert ist. DNA, die an Dritte weitergegeben wird, unterliegt den gleichen Bedingungen. Im allgemeinen werden Aliquote von 25 µl versendet (größere Mengen stehen u.U. auf Anfrage zur Verfügung (Anfrage).
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Spezielle DNA-Extraktion, kann auf Anfrage erfolgen, wenn entsprechendes Ausgangsmaterial am BGBM vorhanden ist oder dies unter Angaben der vollständigen Dokumentation zur Verfügung gestellt wird.
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Anfallende Gebühren für die erste Probe einer Bestellung betragen zur Zeit 15 €. Jede weitere Probe dieser Bestellung kostet 10 €. Die DNA-Entnahme auf Wunsch beläuft sich auf 25 € für die erste und 20 € für alle weiteren Proben, wenn sie zur gleichen Zeit bestellt werden.
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Die gelagerte DNA ist in der Regel qualitativ gut und weist eine angemessene Konzentration auf, um PCR-basierte Analysemethoden durchführen zu können. Eine Qualitätsminderung als Folge inadequat konservierten Herkunftsmaterials kann gelegentlich auftreten, ebenso wie niedrige molekulare Konzentration in Taxa mit geringem DNA-Gehalt. Die Qualität und Konzentration von Proben und ihre Eignung für entsprechende molekularbiologische Anwendungen kann deshalb nicht garantiert werden (z.B. ist degenerierte DNA ungeeignet für AFLP-Analysen). Proben, die während des Versandes degenerieren, werden kostenfrei ersetzt.
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Zur Bestellung von DNA-Material drucken Sie bitte das entsprechende Bestellformular aus, unterschreiben die Vereinbarung, und schicken beides an die folgende Adresse:

Dr. Birgit Gemeinholzer
Botanischer Garten und Botanisches Museum Berlin-Dahlem
Freie Universität Berlin
Königin-Luise-Straße 6-8
D-14195 Berlin
Germany
Fax.: +49-30-841 72924

Bei DNA-Bestellung aus dem Botanischen Garten und Botanischen Museum Berlin-Dahlem, akzeptiert der Empfänger die oben genannten Bedingungen und verpflichtet sich, diese einzuhalten.
Eine unterschriebene Kopie der Vereinbarung über die Lieferung von DNA-Material, das hier verfügbar ist, muss der Bestellung beigefügt sein.

Disclaimer / Haftungsausschluss

Seitenverantwortliche: B. Gemeinholzer

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